Служба по портовым и железнодорожным проектам ОАО "УГМК" работает только со специализированными портами, изначально технологически спроектированными и оборудованными передовой техникой для перевалки угля. Специализированные угольные порты используют технологии, при которых перевалка угля производится с помощью вагоноопрокидывателей, системы конвейеров и судопогрузочных машин. Порты используют мощные системы пылеподавления и ветрозащиты, очистные сооружения. АО "Ростерминалуголь" и АО "Восточный Порт" приняли обязательства по экологии, соответствующие международным стандартам. Экологическая безопасность портов осуществляется в соответствии со стандартом ISO 14001:2004 "Системы экологического менеджмента. Перевалка грузов в морском порту".
Служба по портовым и железнодорожным проектам ОАО "УГМК" и управляемые общества реализуют ежегодные планы природоохранных мероприятий, включая реализацию комплексной экологической программы. За последние пять лет инвестиции в данное направление превысили 5,8 млрд руб.
На угольных терминалах АО "Восточный Порт" и АО "Ростерминалуголь" проводится круглосуточный экологический мониторинг, работают аккредитованные специализированные лаборатории и инженеры-экологи, постоянно функционируют мощные аспирационные установки для очистки воздуха и водоочистные сооружения для стоковых и ливневых вод, которые очищают их до уровня рыбохозяйственных показателей.